果蔬冷庫的儲藏管理要做好以下幾點工作：
一是根據果蔬自身的條件控制冷庫中的溫度。因為不同種類的果蔬，它能忍受低溫的能力是各不相同的，不適宜的低溫和冷凍。會影響果實正常的生理功能，引起風味品質的變化或生理病害的產生，這對儲藏是不利的。以水果來講，一般產于南方或夏季成熟的水果，適宜的儲截溫度較高。例如，菠蘿適宜在+5℃左右儲藏，柑橘宜在3-6℃儲藏，香蕉如在+12℃以下儲藏時間太久便不能催熟。而北方生長的，又是秋冬成熟的蘋果、梨等果實，一般都可在0℃左右的溫度中儲藏。例如，金冠、紅星蘋果宜在0.5-1.0℃儲藏，雞冠、國光蘋果宜在-1~0℃儲藏，刀豆、青豆宜在1-3℃儲藏。因此高溫冷藏儲藏水果蔬菜，應根據不同種類控制不同的儲藏溫度。
二是要對果蔬挑選和整理。因為果蔬中含有大員的水分和營養物質，是微生物生活的良好培養基。首先要把機械傷、蟲傷的產品剔除，否則會被微生物污染的果蔬很快就會全部腐爛變質。不同成熟度的果蔬也不宜混在一起保藏。因為較成熟的果蔬再經過一段時間保藏后會形成過熟現象，其特點是果體變軟，并即將開始腐爛。有些果蔬經過挑選后，質量好的、可以長期冷藏的應逐個用紙包裹，并裝箱或裝筐。包盛果蔬用的紙不要過硬或過薄，最好是用經過對果蔬無任何不良作用的化學藥品處理過的紙。有柄的水果在裝箱(筐)時，要特別注意勿將果柄壓在周圍的果體上，以免把別的水果果皮碰破。在整個挑選整理過程中，都要特別注意輕拿輕放，以防止因工作不慎而使果體受傷。
三是果蔬入庫后要采取進一步降溫的辦法。果蔬在采收后，最好在原料產地及時進行冷卻把果蔬內部的熱量散出。冷卻后的果蔬若用冷藏車運到冷庫，可直接入庫進行冷藏。如果原料產地未經冷卻的果蔬，進入冷藏間后，要采取逐步降溫的辦法，防止某些生理病害的發生。例如，紅玉蘋果先在2.2℃儲藏，然后再降到0℃儲藏，可減少紅玉斑點和虎皮病的發生。
