水產品運輸可通過水、陸、空進行。運輸方法包括傳統(tǒng)密閉式運輸法、無水濕法運輸、干法運輸和科技含量高的機組運輸。此外，還有眾多的輔助運輸手段，如麻醉輔助運輸等。
1. 傳統(tǒng)的密閉式運輸法
密封式運輸所使用的工具通常是尼龍袋。運輸方法是先往尼龍袋中注入約1/3袋的水，然后放入適量水產品，排出袋內的空氣后，向袋內充氧，最后將袋口扎緊。但是當所運的魚類是大口鲇、叉尾、云斑和鱖魚等鰭條有硬刺的魚類時，為了防止其將袋子刺破而影響運輸結果，用橡膠皮充氧袋或用2~3層尼龍袋運輸較安全?？蓪⒛猃埓诤笾苯舆\輸，也可以將尼龍袋放在盛有水的大容器內，在水中加冰，讓塑料袋浮于水面。這樣可以起到防震的作用，同時間接降低了水溫，以降低魚的新陳代謝強度，保持了袋內的良好水質。當采用尼龍袋運輸時，途中要注意檢查，是否有松口或者袋子被刺破的情況，要及時換袋和補充氧氣。如果運輸途中不方便攜帶氧氣瓶，可以準備多只已充氧的備用尼龍袋。
2. 無水濕法運輸
還有一些比較特殊的魚，如鰻魚、泥鰍、烏龜和黃鱔等，在運輸中，它們并不一定要完全浸泡在水中，只需要保持皮膚的濕潤即可存活，大大簡化了運輸過程。運輸時采用水草裹住魚體或對魚體淋水等方法以維持一個潮濕的環(huán)境，避免水分的大量蒸發(fā)和表面干燥而影響呼吸，使魚能借助皮膚呼吸作用生存一定時間。但要注意防止太陽直射。此種方法也可長距離（2~6天）運輸，成活率達90%。
3. 干法運輸
干法運輸主要是指無水充氧包裝和低溫木屑包裝運輸。運輸密度大，成本低，不需要進行水質管理。以日本對蝦為例，包裝運輸時直接往袋中放5千克的活蝦，攤平后充氧，然后封口放入泡沫箱中密封。木屑包裝運輸是將已經在-15℃冷凍間內冷凍48小時的木屑鋪在箱底約1厘米，然后攤平放約1.7千克的蝦，再放一層木屑，接著放3.3千克左右的蝦，一般擺2~3層，再蓋上木屑，然后在箱內側封上冰袋，最后封箱。干法運輸時，經過10~18小時，存活率高達90%。
4. 機組運輸
長途且較大規(guī)模活魚運輸時，一般采用集裝箱或者專門的汽車運輸機組，具有自動化、易操作和運輸量大等優(yōu)點。運輸裝置一般由發(fā)電機組、照明裝置、循環(huán)水泵、制氧機、過濾裝置、殺菌裝置和制冷機及活魚倉組成，其中過濾和殺菌是兩個重要環(huán)節(jié)。過濾主要是去除水體中一些固定顆粒物和氨氮，目前應用于過濾的材料也比較多。用于汽車運輸機組中的過濾裝置是：在腈綸棉粗濾和活性炭吸附除臭的基礎上，再用膜式微孔過濾器精濾?；铘~船空間較大，在甲板面積條件許可的情況下，應使過濾面積足夠大，過濾材料為細沙+活性炭+珊瑚石。日本頗受推廣的過濾裝置有兩種：一種是以泡沫分離裝置為主，生物過濾為補充的過濾器；另一種是碳化棉過濾器。有資料顯示，沸石去除氨氮效果顯著。在運輸機組中，用于殺菌的方法主要有臭氧和紫外線殺菌法。
