自動倉儲系統在冷庫的布置是在穿堂的叉車把貨物放在傳送帶上，傳送帶上的貨物首先進入傳輸廊，再從傳輸廊的門進入冷庫冷藏間，一般情況下進傳輸廊的門與出傳輸廊的門相互錯開，目的是減少外界的空氣水分進入冷庫，避免造成傳輸設備或者輸送鏈條結冰，出現制冷故障。

傳輸廊使穿堂與冷藏間隔開，如果冷藏間的庫溫在-20℃，而穿堂的溫度在5~10℃的話，傳輸廊的溫度在這兩者之間，即0~-5℃。這相當于一個過渡間的作用。

安裝自動倉儲系統的冷庫由于輸送貨物要求平穩，與普通的冷庫地面敷設要求不一樣，地面澆筑有一定的要求，地板需一次灌漿完成，不可以二次灌漿或找平層方式處理地坪高差。地板不允許不均勻和下陷。