水套內有積垢時，造成冷卻條件惡化，影響熱傳導性能，將使壓縮機排氣溫度升高，引起許多后患。所以，應定期檢查與清除冷卻水套內的水垢。水垢的形成主要是由于所用的冷卻水中含有機械雜質(如泥沙等)，在水套中發生沉淀；或是水質太硬，例如，石灰及其他化學雜質等也會沉淀形成水垢層，影響冷卻效果。

當水套中積有沉垢，且采用機械方法清除(如用工具鏟刮等)有困難時，可用5%-25%的鹽酸溶液進行酸洗，先將水套內的冷卻水放出，再將鹽酸溶液灌入，根據水垢的硬度與厚度使該溶液在水套中停留12-24h。當水套中有鹽酸溶液存在時，應在水套上留一孔口，以便排出氣體，但須注意不準明火接近該孔。因為鹽酸作用于金屬表面會產生氫氣，與明火接觸將會發生爆炸。水垢溶解之后，應用水清洗水套，以便將溶解后的水垢和殘余鹽酸排出，或用蘇打溶液中和掉可能殘留的鹽酸。