冷鏈物流系統設計需要著重評價以下三個方面：
（一）技術性能評價
冷鏈物流系統設計的技術性能評價，需要考慮冷鏈系統的具體指標。例如，冷鏈網絡性能評價，主要關注冷鏈物流網絡的總體建設水平、布局與規劃、容量與規模等方面；冷鏈物流節點性能評價，主要關注冷藏倉庫、配送中心和物流中心的數量、布局、容量和發展空間等：就單個冷藏倉庫而言，主要關注訂貨量、客戶服務水平、利用率、倉儲容量等。
（二）經濟性評價
經濟性評價主要關注冷鏈物流系統對資源的消耗和系統的產出效益。冷鏈物流系統的消耗費用計算，是指用于規劃項目建設、管理和運營所付出的經濟代價，即所有投入的物質資源和人力資源，一般可用貨幣形式計量。而冷鏈物流系統建設的經濟效益，是指由于冷鏈系統的建設而產生的訂單增加和經濟增值，表現為有冷鏈系統規劃相對于無物流系統時，總費用的節約及其效益增值。當然，由于冷鏈系統的規劃與設計投資巨大，因此需要在一定的年限內才能彌補巨額投資所帶來的成本。
（三）社會環境影響評價
評價一個冷鏈系統的好壞，除了可度量的經濟效益外，還需要考慮它的社會環境影響。同時，也包括其潛在的經濟影響，在一定程度上可能引起的社會環境及自然環境的變化，包括有利的影響和不利的影響。因此，在評價一個冷鏈系統規劃與設計方案時，也會從系統的、可持續發展的角度來考慮。
